２月８日、
平成28年４月１４日21時26分と、
同年4月16日1時25分に
発生した熊本地震によって、
林業関係も甚大な被害を被った。

林道施設1628カ所(11億円)
山地崩壊398ヶ所(342億円)
治山施設被害31ヶ所(26億円)
その他立木や林産物等を含んで、
被害総額406億円となり、
その上に同年の梅雨前線による豪雨災害により、
山地崩壊288ヶ所(127億円)
治山施設被害18ヶ所(3億円)が加わった。
熊本県では、被災直後から
林野庁や九州森林管理局等からの支援を受けて
迅速な現地調査を実施し、
4月26日に激甚災害指定を受け、
5月17日、予備費を活用した
補正予算を成立させた。